Après avoir mené des campagnes de prélèvement au large de la Bretagne, dans les Antilles et en Nouvelle-Calédonie, les scientifiques se trouvent actuellement en Méditerranée, au large de Marseille.
Une mission de recherche ambitieuse
Ce projet scientifique d’envergure vise à collecter plus de 4 000 espèces marines, comprenant des mollusques, des poissons et des algues, pour séquencer leur génome. Baptisé Atlas Sea, ce programme a pour objectif de constituer un atlas des génomes marins afin de mieux comprendre la biodiversité et de découvrir des molécules d’intérêt. L’équipe de recherche est active jusqu’au 28 juin pour explorer les eaux méditerranéennes.
Collecte des échantillons en mer
Il est 6h du matin lorsque Damien, le capitaine du navire de recherche, met le cap sur le large. Sur le pont arrière, les scientifiques et techniciens se préparent à collecter des espèces évoluant à 60 mètres de profondeur, telles que des vers, des polychètes, des petits crustacés et des mollusques. L’équipage utilise une drague et une benne pour récupérer des échantillons, y compris des échinodermes comme des oursins et des étoiles de mer.
Impact des plastiques sur l’écosystème marin
Malheureusement, en plus des espèces marines, l’équipage découvre également des déchets plastiques. Un technicien souligne que certains déchets, comme un emballage de glace, seront conservés pour étudier les espèces qui pourraient se développer dessus et potentiellement les dégrader. Il est crucial que les organismes prélevés restent vivants pour que leur ADN soit préservé.
Analyse des échantillons
Une fois arrivés à la station marine sur la corniche de Marseille, les échantillons sont tamisés puis observés au microscope. Un mollusque, un polyplacophore, est photographié, congelé à -80 degrés et envoyé dans les laboratoires du Genoscope, près de Paris, où les chercheurs pourront analyser son génome. Cette recherche pourra permettre d’identifier des molécules d’intérêt, notamment des antibiotiques produits par certaines espèces marines.
Avancées du programme Atlas Sea
En deux ans, le programme Atlas Sea a déjà permis de récolter 1 500 espèces sur les 4 500 ciblées, avec près de 100 génomes séquencés. Selon Bertrand Bed’home, professeur au Muséum d’Histoire Naturelle, la compréhension des génomes marins pourrait ouvrir la voie à la production de molécules d’intérêt en dehors de leur milieu naturel.